农村房屋买卖协议如果依法成立的有法律效力。《民法典》规定的合同有效要件是：当事人具有相应的民事行为能力；意思表示真实；合同依法订立；不违背公序良俗。《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
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只有买卖双方的协议书，不经过买卖房屋登记，就没有所买的房屋产权，在物权上是不生效的。
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房屋买卖纠纷，违约责任是如果补充协议有约定按补充协议处理，没有约定按合同处理；补充协议一般理解为是对合同的补充或变更。