关于法庭上双方同意离婚但抚养权有争议的情况，法院会根据夫妻感情是否破裂以及子女权益来做出判决。依据《中华人民共和国民法典》的规定，会先进行调解，若调解无效且感情确已破裂，则准予离婚。对于抚养问题，法院会秉持最有利于未成年子女的原则进行判决，以确保孩子的成长环境不受影响。
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在法庭上，如果夫妻双方同意离婚但对子女抚养权存在争议，法院会根据双方的协商情况和子女的实际情况进行判决。诉讼过程中，法院将依据最有利于子女成长的原则来做出裁决。因此，双方可以尝试通过协商达成一致，避免长时间的诉讼对双方和孩子的伤害。
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针对法庭上夫妻双方对抚养权有争议的情况，法院会根据具体情况进行判决。如果双方能够通过协议达成一致意见，将更有助于快速解决争议。如果无法达成协议，可以向法院提起诉讼，法院将会依据最有利于孩子的原则进行裁决。在判决过程中，法院会综合考虑双方的实际情况和孩子的成长需要。